MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Phaeobacter gallaeciensis DSM 17395 plasmid pPGA1_78

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018287	CGC	2	6	10	15	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018287	TGT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018287	GGC	2	6	1471	1476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018287	GCA	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018287	GCA	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018287	CGG	2	6	4494	4499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018287	GC	3	6	4512	4517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018287	GCG	2	6	4523	4528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018287	GGCA	2	8	5516	5523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018287	GAC	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018287	TA	3	6	5615	5620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018287	C	6	6	5654	5659	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_018287	GA	3	6	5675	5680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018287	TCA	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018287	GA	3	6	5739	5744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018287	CCCG	2	8	7939	7946	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_018287	T	7	7	7965	7971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018287	GAG	2	6	8069	8074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018287	ATG	2	6	8442	8447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018287	GCG	2	6	8457	8462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018287	TCT	2	6	8488	8493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018287	TC	3	6	9938	9943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018287	GCC	2	6	10504	10509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018287	ACAG	2	8	11807	11814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018287	CG	3	6	11816	11821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018287	TGT	2	6	13199	13204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018287	GCA	2	6	13242	13247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018287	CCA	2	6	13297	13302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018287	TCC	2	6	13345	13350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018287	T	6	6	13410	13415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018287	GTT	2	6	13416	13421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018287	GGT	2	6	13460	13465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018287	CAC	2	6	13512	13517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018287	GCCC	2	8	13604	13611	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_018287	TTGA	2	8	13631	13638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018287	CCG	2	6	13712	13717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018287	GCC	2	6	13934	13939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018287	TTG	2	6	13958	13963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018287	CGG	2	6	13972	13977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018287	TG	3	6	13986	13991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018287	GC	3	6	15550	15555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018287	TTCT	2	8	15597	15604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018287	GGA	2	6	19013	19018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018287	GC	3	6	20272	20277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018287	TC	3	6	22196	22201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018287	CGG	2	6	25236	25241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018287	TTA	2	6	26174	26179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018287	TGC	2	6	26222	26227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018287	AGCC	2	8	30289	30296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018287	CGC	2	6	30313	30318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018287	GCGG	2	8	30330	30337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018287	CTCC	2	8	31023	31030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_018287	TGG	2	6	31074	31079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018287	TC	3	6	32547	32552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018287	GAG	2	6	32558	32563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018287	GGTC	2	8	33572	33579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018287	AGG	2	6	33585	33590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018287	GCA	2	6	33630	33635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018287	GGCA	2	8	33644	33651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018287	ACC	2	6	33669	33674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_018287	GGA	2	6	33680	33685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018287	AATC	2	8	35072	35079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018287	CTG	2	6	36630	36635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018287	GGGCC	2	10	36638	36647	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_018287	TCCC	2	8	36667	36674	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_018287	CCG	2	6	36683	36688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018287	CGG	2	6	36697	36702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018287	ACC	2	6	36704	36709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018287	CCTC	2	8	39585	39592	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_018287	CGG	2	6	39622	39627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018287	GTC	2	6	41407	41412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018287	CTG	2	6	41436	41441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018287	CG	4	8	41996	42003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018287	GGCT	2	8	47212	47219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018287	GGC	2	6	47247	47252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018287	CCG	2	6	47272	47277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018287	AAT	2	6	47328	47333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018287	GC	3	6	49492	49497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018287	CAT	2	6	49575	49580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018287	CGC	2	6	49603	49608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018287	GCC	2	6	49612	49617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018287	CCG	2	6	49661	49666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018287	GA	3	6	49723	49728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018287	GCC	2	6	49776	49781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018287	CCG	2	6	56862	56867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018287	TTC	2	6	58859	58864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018287	CAT	2	6	58866	58871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018287	GC	4	8	58881	58888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018287	GCC	2	6	58894	58899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018287	CTGC	2	8	58926	58933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018287	GCC	2	6	58942	58947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018287	CCA	2	6	58986	58991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018287	CG	3	6	59028	59033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018287	GA	3	6	59058	59063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018287	GAG	2	6	60502	60507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018287	TCAAA	2	10	60522	60531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018287	CA	3	6	60572	60577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018287	AG	3	6	60582	60587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018287	CCT	2	6	60599	60604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018287	CAA	2	6	60614	60619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018287	GCC	2	6	60629	60634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018287	C	6	6	60652	60657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_018287	GTG	2	6	60683	60688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018287	CGC	2	6	61787	61792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018287	CGC	2	6	61806	61811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018287	TTC	2	6	61821	61826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018287	CTG	2	6	61828	61833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018287	CCGC	2	8	61849	61856	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_018287	GCC	3	9	61870	61878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018287	GCT	2	6	61880	61885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018287	GTT	2	6	63161	63166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018287	TTGG	2	8	68510	68517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018287	GC	3	6	68539	68544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018287	TCAGG	2	10	68596	68605	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018287	CGA	2	6	69456	69461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018287	GCC	2	6	70378	70383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018287	GTGG	2	8	70384	70391	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018287	ACCC	2	8	71401	71408	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_018287	AGCG	2	8	71463	71470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018287	GCA	2	6	71517	71522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018287	CGC	2	6	71545	71550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018287	CAA	2	6	71556	71561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018287	GCT	2	6	71586	71591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018287	GT	3	6	71606	71611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018287	GTGCG	2	10	71636	71645	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018287	CCG	2	6	71661	71666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018287	GGA	2	6	73808	73813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018287	GCA	2	6	73869	73874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018287	AGA	2	6	73896	73901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018287	TGG	2	6	74820	74825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018287	T	6	6	74867	74872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018287	CTG	2	6	74900	74905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018287	GCT	2	6	74949	74954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018287	GCGG	2	8	74972	74979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018287	C	6	6	74986	74991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_018287	GGGC	2	8	75032	75039	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018287	GT	3	6	75055	75060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018287	TCTGCG	2	12	75062	75073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018287	CCG	2	6	75092	75097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018287	GCT	2	6	77559	77564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018287	TCT	2	6	77642	77647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018287	TCG	2	6	77717	77722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018287	T	6	6	77781	77786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018287	GAT	2	6	77885	77890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018287	GTG	2	6	78080	78085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018287	GC	4	8	78094	78101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018287	CTG	2	6	78111	78116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018287	CGG	2	6	78126	78131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018287	CTGCG	2	10	78151	78160	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_018287	CTGCG	2	10	78175	78184	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_018287	ATCC	2	8	78205	78212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.